Nel Santuario della Basilica fu inaugurato nel 2000, in occasione dell’Anno Santo, il Museo "Annibale Di Francia". La sua particolarità sta nella ricostruzione in scala 1 a 2 di tutto il "Quartiere Avignone", come lo vide Sant’Annibale durante la sua prima visita ai poveri abitanti, soprannominati "mignuri". Il Museo, realizzato in due anni in base ai progetti dell’Ing. Livio Lucà Trombetta, propone la figura e l’opera del noto sacerdote messinese. Ad accogliere i visitatori, all’inizio del percorso espositivo, c’è il pulpito, già presente nel Santuario prima della sua ristrutturazione del 1976. Nel corridoio d’ingresso del Museo trovano spazio anche i disegni dell’Architetto Antonio Favaloro, che, come testimone oculare, ha riprodotto fedelmente la struttura e la topografia del quartiere. Tra le opere esposte, una statua in marmo del XVII secolo raffigurante la Madonna delle Grazie, opera dello scultore romano Vincenzo Tedeschi, che venne trasportata nella Chiesa dell’Annunziata vicino al torrente Zaèra dopo il terremoto del 1783.
