Il Museo del Santuario di N. S. di Misericordia, ubicato accanto alla chiesa edificata dopo l’apparizione della Vergine a Antonio Botta il 18 marzo 1536, racconta la lunga storia e l’evoluzione della devozione alla Madonna di Misericordia. La collezione di opere d’arte donate dal maestro Eso Peluzzi è stata inserita nella Sala Peluzzi, e aggiunta al Museo del Tesoro, sorto negli anni ’50 del ’900. Oggi i due luoghi formano un unico percorso, chiamato "Museo del Santuario". L’esposizione inizia con le opere risalenti alla seconda metà del ’500 e termina con quelle più recenti, presentando oggetti di diversa natura caratterizzati dall’importanza e rispettabilità dei committenti, tra cui Papa Pio VII e la famiglia reale Savoia. Il Museo del Santuario è stato riaperto al pubblico il 3 luglio 2009 dopo interventi di manutenzione.
