Na rocha riolítica do "Castelo" de Lipari ergue-se um complexo museológico. É uma imponente cúpula de formação vulcânica que tem as características de uma fortaleza natural. Composto por seis pavilhões, o museu documenta e ilustra, através dos artefactos expostos, os assentamentos humanos e o desenvolvimento das civilizações, desde a Pré-História até aos primeiros passos da Idade Moderna, que se sucederam no Arquipélago das Eólias.
A exploração científica é apoiada por um aparelho educativo completo e exaustivo. Além disso, dentro da Secção Pré-Histórica, da Secção das Ilhas Menores e da Secção Clássica, estão disponíveis estações de computador, para aqueles que desejam aprofundar os complexos expostos no museu e as emergências arqueológicas e/ou monumentais do Castelo.