O Museu Cívico Medieval de Bolonha está sediado no Palácio Ghisilardi-Fava desde 1985. As duas salas iniciais contam a história do Museu: a sala das "maravilhas" de Ferdinando Cospi, montada em 1675 no Palácio Público e a coleção "experimental" do General Luigi Ferdinando Marsili, estabelecida no âmbito do Instituto de Ciências (1714).

No período entre 1742 e 1743, o Palácio Poggi tornou-se a sede dos dois núcleos, que cresceram com a doação do Papa Bento XIV. As obras expostas nestas salas resultam da seleção tipológica de diferentes coleções: entre os testemunhos exóticos encontram-se ovos de avestruz, cocos embelezados com gravuras e outros objetos de origem ou gosto oriental.

O percurso do museu continua depois com o núcleo medieval e do início do Renascimento, com obras ligadas às da cidade de Bolonha, como a "Estátua de Bonifácio VIII", executada em 1301 pelo ourives Manno Bandini de Siena, para o Palácio Público, mas também o "São Pedro Mártir", feito por Giovanni di Balduccio e as esculturas da Loggia della Mercanzia.

Continua depois com os monumentos fúnebres dos doutores, como o atribuído a Jacopo Lanfrani e os realizados por Pier Paolo delle Masegne e Andrea da Fiesole. Entre as outras obras escultóricas está a "Lastra Garganelli", atribuída a Francesco del Cossa.

Entre os bronzes estão o modelo para a "Fonte de Neptuno" de Giambologna, o "Busto de Gregório XV" de Bernini e o "São Miguel Arcanjo" de Alessandro Algardi. Entre os marfins há um "Tríptico", pertencente à oficina dos Embriachi e exemplares da Serra Leoa (séculos XV-XVI).

Como demonstração da florescente produção de artes decorativas, o Museu também alberga exemplares de joias e medalhas, vidros, tecidos e armas, da família Bentivoglio e Marsili, como a armadura de torneio da família Cospi (século XVI). Desde 1995, o percurso expositivo também inclui uma importante coleção de códices iluminados de Bolonha dos séculos XIII a XVI e uma extensa coleção de cerâmica com 300 peças, pertencentes aos séculos XIII a XIX.