O Museu, que ilustra a história da comunidade judaica florentina, está distribuído por dois andares. A primeira secção, que pretende contar a relação entre a comunidade e a cidade ao longo dos anos, contém exemplares de mobiliário dos séculos XVI a XVIII, utilizados para cerimónias sinagogais, enquanto a segunda exibe objetos e mobiliário que retratam momentos e festividades significativos, como nascimentos, casamentos ou maiorias religiosas. Além disso, há a Sala da Memória, dedicada à história dos judeus florentinos, com documentos fotográficos e arquivísticos. Para completar o percurso, existem duas salas equipadas: uma para projeções com filmes e documentários, e a outra equipada com computadores ligados às principais bases de dados de museus e centros de investigação judaicos de todo o mundo.