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Há vários anos que o Museu tem vindo a reforçar as suas estruturas com vista a um programa de desenvolvimento plurianual. O itinerário da exposição está distribuído por várias salas temáticas: a Sala das Eras Geológicas, dedicada ao aparecimento e evolução da vida no mar e em terra do período Paleozóico ao Quaternário, a Sala das Ciências da Terra, dedicada ao nascimento do sistema solar e do planeta Terra, aos processos internos e externos que regulam a existência da vida, bem como aos fósseis e à fossilização.
