Depuis plusieurs années, le Musée renforce ses structures dans la perspective d'un programme de développement pluriannuel. L'itinéraire de l'exposition est réparti en plusieurs salles thématiques : la salle des âges géologiques, consacrée à l'apparition et à l'évolution de la vie en mer et sur terre de la période paléozoïque au quaternaire , la salle des sciences de la Terre, consacrée à la naissance du système solaire et de la planète Terre, aux processus internes et externes qui régissent l'existence de la vie, ainsi qu'aux fossiles et à la fossilisation.