Le Musée est né à la suite d'un don d'un premier noyau d'œuvres par Marino Marini lui-même, qui avait un lien fort avec la ville de Florence , dans les années de sa formation, il avait en effet suivi les cours de peinture et de sculpture de l'Académie florentine des Beaux-Arts.

Au premier noyau s'ajoutent des dons ultérieurs de la femme de l'artiste et d'autres donateurs privés , actuellement, le musée conserve 183 œuvres, entre sculptures, peintures, dessins et gravures des années 1916 à 1977, réparties sur les quatre niveaux du musée situé dans l'ancien complexe de San Pancrazio.

L'artiste travaille sans relâche sur les thèmes du chevalier et du cheval ou de Pomona et, dans les années qui ont précédé le déclenchement de la Seconde Guerre mondiale, il mène une recherche sur les formes « pures » en regardant la tradition comme la leçon de Giotto. Ce sont les années où il expose avec les artistes du groupe Novecento qui réfléchissent sur des thèmes similaires. Après la guerre, les formes commencent à s'ouvrir et l'harmonie cavalier-cheval devient conflictuelle.

Le critère d'aménagement adopté dans le musée est très intéressant, non chronologique mais thématique , une attention particulière a été portée à la manière dont la lumière naturelle interagit avec les œuvres exposées, dans le respect de la vision de l'artiste qui considérait la lumière comme un élément indispensable pour la lecture de son œuvre.

Le parcours de visite comprend l'accès à un petit joyau de la Renaissance, la chapelle Rucellai ou le temple du Saint-Sépulcre, commandé par le puissant Giovanni Rucellai à l'architecte et théoricien de la Renaissance italienne Leon Battista Alberti. CC

Sur demande, le musée accueille dans ses espaces des événements privés ainsi que des dîners et des cocktails ou des conférences et des présentations d'entreprise.