A Pinacoteca alberga uma grande coleção de pinturas e esculturas em madeira, que remontam à segunda metade do século XIII, à primeira metade do século XIV, aos séculos XIV e XV e aos séculos XIII, XIV, XV e XVI. Entre os nomes mais importantes estão: o Mestre de Santo Agostinho, o Mestre de Santo Emiliano, Allegretto Nuzi, o Mestre de Staffolo, Antonio da Fabriano, Rainaldetto di Ranuccio da Spoleto, Ottaviano Nelli, o Mestre de Fossato, Bernardino di Mariotto, Puccio di Simone, Bicci di Lorenzo, Neri di Bicci e Andrea Boscoli. O altar gótico do século XIV, proveniente do Oratório do Santo Sepulcro de Santo Agostinho, fundado em 1393 pelos Beatos Pietro e Giovanni Becchetti, é outra obra preciosa preservada na Pinacoteca.