Le musée lapidaire de Todi, situé à l'intérieur du complexe des Lucrezie, un pôle muséal dont il constitue la première section, se trouve dans le quartier de Nidola et ses origines remontent à la première moitié du XVe siècle. Ce bâtiment a été légué par Madame Lucrezia della Genga aux sœurs en 1425, puis agrandi avec l'acquisition de propriétés adjacentes. La prospérité du monastère a été interrompue par la crise économique qui a touché les ordres religieux à la fin du XVe siècle, les glissements de terrain qui ont frappé la région vers 1760, la confiscation due aux lois napoléoniennes et la suppression des corporations religieuses en 1862. Après la Première Guerre mondiale et jusqu'en 1987, l'ensemble de la structure a été utilisé à des fins diverses jusqu'à ce que, dans le cadre de la loi spéciale n° 545 de 1987, il fasse l'objet d'une restauration. Le Lapidaire conserve des matériaux en pierre appartenant à la municipalité, datant de l'Antiquité, du Moyen Âge et de l'époque moderne, qui ont été retrouvés dans la ville et ses environs à la suite de divers déplacements, jusqu'à ce qu'ils trouvent leur lieu d'exposition actuel en 2008. Le parcours du musée comprend plusieurs sections qui suivent un ordre chronologique de l'époque romaine au XIXe siècle.