La famille de la Corgna, propriétaire d'un puissant marquisat, commanda la construction du palais, situé au centre de l'aménagement urbain dont elle était le centre, au milieu du XVIe siècle. Ascanio, le plus grand représentant de la famille, était responsable de cet arrangement, qui consistait également en la régularisation des propriétés antérieures des Baglioni. Par la suite, le palais fut agrandi et achevé par les successeurs d'Ascanio. Les fresques qui ornent les salles représentent l'un des plus grands exemples de décoration de la noblesse en Ombrie, ainsi qu'un moyen d'exalter les exploits d'Ascanio et de recourir à des thèmes mythologiques liés au territoire du lac Trasimène. En 1574, Diomede della Penna della Corgna, neveu d'Ascanio, confia la réalisation de la décoration à un certain Niccolò Circignani, dit le Pomarancio. Parmi les collaborateurs, Giovanni Antonio Pandolfi est particulièrement remarquable, dont la main est reconnaissable dans certaines scènes de la salle de l'Énéide. Pour faciliter davantage les déplacements, les della Corgna firent construire un chemin de ronde qui reliait la forteresse médiévale, garnison de Pérouse de contrôle du lac Trasimène, au palais.