Au cœur du complexe des institutions culturelles de Rimini, le musée a été créé en 1990, en réunissant les collections municipales déjà existantes dans la ville, à savoir la collection archéologique, organisée par Luigi Tassini en 1844, et la pinacothèque, fondée en 1924. Doté de services éducatifs et d'information modernes, le musée abrite des matériaux provenant de fouilles archéologiques, de bâtiments démolis, de dépôts et de dons, qui racontent l'histoire de Rimini et de son territoire. Le premier noyau des collections municipales fut le Lapidaire, installé en 1981 dans la cour intérieure du Collège grâce au travail de Giancarlo Susini et Angela Donati. Composé de 68 inscriptions, allant du Ier siècle av. J.-C. au IVe siècle ap. J.-C., il comprend d'importantes stèles funéraires et des bases honorifiques, ainsi que des fragments architecturaux et des éléments de grand intérêt pour la construction, tels que l'acte administratif concernant le pavage des rues de Rimini promu par Gaius Caesar. La section archéologique se développe à partir des souterrains du Collège des Jésuites, où, dans une quarantaine de salles, l'histoire de Rimini est retracée, des premiers témoignages d'Homo erectus retrouvés sur la colline de Covignano jusqu'à la fondation d'Ariminum en 268 av. J.-C. par les Romains et le développement de la ville à l'époque républicaine et moyenne impériale, pour ensuite continuer avec un regard approfondi sur les événements qui ont animé Rimini à l'époque impériale, au cours des IIe et IIIe siècles apr. J.-C.

À la sélection variée et enchanteresse de mosaïques romaines, dont la célèbre mosaïque « des bateaux » de la domus du palais Diotallevi et la mosaïque « d'Anubis », s'ajoute le très précieux tableau en pâte de verre polychrome représentant des poissons et le plus riche équipement chirurgical de l'antiquité, tous deux retrouvés dans la Domus du chirurgien voisine qui, récemment muséifiée, constitue le prolongement extérieur naturel de l'itinéraire du musée. Le parcours du musée s'articule en une soixantaine de salles disposées sur trois étages. La section historique et artistique, avec environ cinq cents œuvres exposées, permet au visiteur de découvrir l'art de Rimini dans les évolutions qui le caractérisèrent du XIVe au XIXe siècle. La collection expose en premier lieu la célèbre école du XIVe siècle représentée par Giuliano et Giovanni da Rimini et leurs élèves. La célèbre Pietà de Giovanni Bellini (1460) et le tout aussi célèbre retable de S. Vincenzo Ferreri del Ghirlandaio (1494) renvoient à la saison Malatesta, suivis des œuvres de Benedetto et Bartolomeo Coda, (comme le retable de Benedetto Coda Madonna col Bambino e Santi, et L'Ultima cena de Bartolomeo Coda) Bagnacavallo, Mastelletta, Salvator Rosa, Guercino, Cagnacci, Maffei, Piazzetta, Marchetti, Pittoni et Bigari.

Une autre section du musée est dédiée au peintre rimini du XIXe siècle Guglielmo Bilancioni, tandis que deux autres salles accueillent les dessins, les peintures et les œuvres graphiques de René Gruau, un artiste qui a travaillé avec les plus grands créateurs, dont Dior, Chanel, Givenchy et Balenciaga.

Parmi les témoignages de l'histoire locale, citons également les neuf tapisseries qui décorent les salles municipales, tissées à Anvers au XVIIIe siècle sur des cartons d'A. Van Diepenberk, le célèbre « saracino » utilisé dans les manèges du XVIIe siècle et la série des armoiries (XVIe-XVIIe XVI-XVII) provenant des palais nobiliaires les plus prestigieux de la ville ainsi que d'autres fragments de pierre. L'importance d'Ariminum, l'une des plus anciennes villes fondées par les Romains d'Émilie-Romagne, est bien mise en évidence dans la section archéologique, grâce à la succession de thèmes et de matériaux qui racontent clairement les relations avec la mère patrie Rome, le système politico-social en vigueur, son économie florissante et ses activités productives tout aussi florissantes. Chaque pièce de l'exposition est un témoignage des formes d'artisanat de l'époque, une reconstitution des environnements domestiques avec leurs meubles, équipements et accessoires précieux. Les objets proposés proviennent des riches domus de la ville et décrivent le type de relations entretenues par la ville portuaire avec la mer et les trafics qui l'unissaient à l'Orient et à l'Afrique, en reconstituant les formes de culte public et privé auxquelles s'ajoutent les grandes structures architecturales urbaines telles que l'amphithéâtre. Les reconstructions de la Domus du Chirurgien méritent une place de choix absolue, dont une reproduction de certaines pièces telles qu'elles étaient à l'époque est présentée au public : le cabinet médical, la chambre, la salle à manger avec son ameublement, les sols, les décorations, le mobilier retrouvé lors de l'exploration archéologique. La domus était en effet dotée d'ornements précieux tels que des mosaïques, des enduits et des décorations murales colorées, précieuses et suggestives. Comme cela a été dit, les opérations de fouilles ont également permis de récupérer les outils professionnels du chirurgien, presque tous, qui représentent un indice matériel et culturel incroyable et fondamental de la pratique médicale dans l'Antiquité. Dans l'ensemble, la domus constitue un rare cas de cabinet médical, qui combine la résidence du médecin avec des espaces conçus pour l'accueil, la visite et les soins des patients, ainsi que des espaces dédiés à la préparation des médicaments.