A igreja de São Zeno no Oratório (também chamada San Zenetto para a distinguir de Zeno Maggiore) ficava perto da Via Postumia, fora do círculo das muralhas urbanas romanas e, em particular, desde o século XII, perto da Porta del Morbio (agora incluída nas muralhas de Castelvecchio). A ponte sobre o rio Ádige, anterior à construção da ponte ameada de Castelvecchio (1354), estava localizada mais ou menos no eixo da igreja. O edifício sagrado atual foi construído entre os séculos XII e XIII, de acordo com o estilo típico do românico veronês. A fachada tripartida com uma rosácea central, que recorda a de São Zeno Maggiore, reflete a divisão interna em três naves separadas por arcos e colunas. O presbitério é elevado e mostra o vão central coberto por uma cúpula de alvenaria com uma lanterna no topo.
No seu destino como igreja ligada ao rio (mas também à foz do canal chamado Adigetto, que fechava a cidade antiga na curva do rio), enfrentou inúmeras inundações, a mais recente das quais foi a desastrosa de 1882. Outros danos ocorreram quando o exército alemão em retirada explodiu a ponte do século XIV em 1945.
A igreja acolhe a relíquia mais curiosa atribuída ao santo bispo Zeno, ou seja, a pedra sobre a qual o santo, segundo a tradição, costumava pescar no Ádige. A relíquia também tem um forte significado simbólico: São Zeno evangelizador também era "pescador de homens". A pedra está agora apoiada num altar fúnebre romano de forma cilíndrica, que contém uma edícula decorada com cachos e folhas de videira em redor de dois bustos de um homem e de uma mulher.