Le parc archéologique comprend, dans un riche cadre boisé, les restes d'un castrum du Ve siècle apr. J.-C. sur des préexistences militaires du IVe siècle apr. J.-C.
L'imposant circuit de murailles du castrum et le complexe cultuel de San Giovanni Evangelista ont été rénovés par les Lombards au VIIe siècle et utilisés pour les sépultures des aristocrates. À l'époque lombarde, la région fut le siège d'un Gastaldo qui promut la construction de bâtiments de valeur tels que l'église Santa Maria foris portas et le monastère de Torba. Exemple significatif de la création de noyaux de pouvoir dans le territoire rural, la colonie est définie par les murs d'enceinte qui s'étendent jusqu'à Torba.
Au-delà de la porte principale se trouve le complexe de San Giovanni, avec la basilique, le baptistère attenant, la citerne monumentale et un clocher. Dans le baptistère, on peut voir des traces de fresques murales et d'un sol en petites dalles de marbre (opus sectile). Le complexe, datant de sa première phase du Ve-VIe siècle, a ensuite été progressivement abandonné.
Au sud de San Giovanni se trouvent les ruines de San Paolo, une église à plan central hexagonal, et au nord et à l'est se trouvent les restes de deux tours romaines et de quelques bâtiments d'habitation et de service.
À l'intérieur du parc archéologique de Castelseprio se trouve l'Antiquarium, qui propose au visiteur les découvertes les plus importantes faites dans le cadre des recherches archéologiques dans l'ancienne Castelseprio, retraçant l'histoire du site depuis les premières présences à l'époque préhistorique jusqu'à la dernière fréquentation monastique à la fin du Moyen Âge.