As Grutas do Vaticano abrem-se sob a nave central da Basílica de São Pedro, entre o piso da basílica de Constantino e o atual. As escavações realizadas por Pio XII mostraram que a primeira Basílica de São Pedro não foi construída no circo de Nero, mas numa necrópole pré-constantiniana. Acolhem túmulos de papas (nomeadamente o de Bonifácio VIII) e a Necrópole pré-constantiniana.
As Grutas Novas (assim chamadas porque são mais recentes e geralmente não podem ser visitadas), desenvolvem-se em torno da capela de São Pedro, construída sobre o túmulo do apóstolo e também chamada "Clementina", pois foi ricamente decorada na época de Clemente VIII.
As Grutas Velhas podem ser visitadas descendo da basílica através da estreita escadaria sob um dos pilares da cúpula e remontam a 1606, quando Paulo V ordenou a demolição da parte frontal da antiga basílica. São compostas por 3 naves sob a nave central da basílica do Vaticano. Guardam os túmulos de muitos pontífices que quiseram o seu túmulo ao lado do de São Pedro. Há o túmulo de Bonifácio VIII, com a figura do pontífice deitado numa urna drapeada, e os de Bento XV, Pio XI, Pio XII, Paulo VI e João Paulo I. Há também os de alguns soberanos, incluindo a rainha Cristina da Suécia e a rainha de Chipre.
Piazza San Pietro, 00120 Città del Vaticano