La salle capitulaire, qui s'appelait autrefois la salle du Trebbio, a été construite par les moines cisterciens dans la première moitié de l'année 1225 , depuis 1905, elle est le siège de la Vénérable Confrérie du Saint-Sacrement et du Saint-Rosaire. On accède à cette pièce par l'ancien cloître, appelé Claustrum Monasterii. Elle se présente comme une vaste salle rectangulaire qui s'étend du bras nord du transept, où une division a été réalisée avec l'environnement qui sert de sacristie, située à proximité de l'église. Il s'agit d'un bâtiment à nef unique, divisé en trois travées, couvertes de trois croisées avec des supports à colonnes et une grande arcade. Lors des restaurations du XVIe siècle, elle fut allongée d'une travée, rappelant ainsi la croix gothique typique. Sur la droite, il y a deux portes, l'une qui mène à l'Armarium et l'autre murée qui mène à la sacristie , sur le linteau est gravée la date de consécration, à savoir 1225. L'Armarium, datant de la première moitié du XIIIe siècle, était la bibliothèque des moines et a été décoré de fresques en 1503 et en 1650. Il abrite aujourd'hui le musée capitulaire de la Confrérie, qui expose des œuvres et des meubles qui témoignent de la vie de l'abbaye cistercienne et, plus tard, de celle de la Confrérie au cours des siècles. Les décorations dites « grottesques » des voiles de la salle, réalisées dans la seconde moitié du XVIe siècle et attribuées à Luzio Romano, ont été réalisées en l'honneur d'Alessandro Farnese, le commanditaire. Les décorations des bandes centrales et des lunettes, qui remontent à la première moitié du XVIIe siècle et sont l'œuvre de Gaspard Doughet, représentent les possessions de la famille Pamphili. Au centre de la bande, avant la dernière croisée, se trouve le blason en stuc polychrome d'Ottaviano Riario Visconti, évêque de Viterbe de 1506 à 1523. Le sol en marbre noir et blanc, réalisé par Francesco Borromini, ressemble à celui des nefs latérales de Saint-Jean-de-Latran.

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