Acqualagna se dresse le long de l'ancienne via Flaminia, au sud-ouest de la gorge du Furlo, à l'intérieur de laquelle les Romains ont creusé deux tunnels dans la roche à l'endroit où le transit était le plus problématique : le grand tunnel, achevé en 76 après J.-C. à la demande de l'empereur Vespasien, est encore aujourd'hui ouvert à la circulation piétonne et automobile. La zone fait partie de la réserve naturelle nationale de la gorge du Furlo. Près de ce qui est aujourd'hui le village se trouvait une ville romaine, Pitinum Mergens, qui fut détruite par Alaric : les habitants qui survécurent à la destruction fondèrent le château de Montefalcone à partir duquel, à la fin du Moyen Âge, le village se forma. Au Moyen Âge, elle fut gouvernée par les Montefeltro, seigneurs d'Urbino. L'abbaye de San Vincenzo al Furlo mérite certainement une visite. Mais Acqualagna n'est pas seulement histoire et nature : au niveau national, elle est définie comme la «Capitale de la Truffe», à ce précieux tubercule sont dédiés des événements et des manifestations, à ne pas manquer, cependant, est la Foire nationale de la Truffe, qui se tient chaque année entre octobre et novembre.