La visite du Musée diocésain est une occasion précieuse d'en apprendre davantage sur l'histoire de la ville et de redécouvrir certaines œuvres qui témoignent des vicissitudes de l'Église de Gênes. On y trouve des objets d'art et des représentations figuratives fermement liées aux rites et à la religiosité des communautés autochtones. La production artistique exclusive liée à l'histoire du diocèse est présentée dans l'ordre chronologique. Des vestiges archéologiques de l'époque romaine et des objets funéraires qui racontent les faits les plus anciens sont conservés dans les salles souterraines. Les « fonds d'or » de Barnaba da Modena, un fragment de la fresque de la chapelle de Marini de Cristoforo De' Mottis, d'autres sculptures du XIVe siècle, l'extraordinaire monument funéraire du cardinal Luca Fieschi sont les exemples les plus importants de peinture et de sculpture médiévales et de la Renaissance en Ligurie. Le « Polyptyque de San Lazzaro » de Pietro Francesco Sacchi, le « Dossier avec les histoires du Baptiste » peint par Teramo Piaggio et Andrea Semino, ainsi que « La Pietà » avec San Giovanni Battista et San Nicola da Tolentino d'Agostino Bombelli sont des œuvres qui éclairent l'évolution de l'art figuratif génois de la première moitié du VIe siècle. L'antépendium sur lequel est représentée la « Lamentation sur le Christ mort », réalisée par un brodeur flamand anonyme vers 1515, et le précieux « Repositorio » en argent repoussé, fini en or et offert à l'église San Siro en 1615 par Placida Doria, petite-fille du grand amiral, dont les représentations figurent ensemble sur le bandeau de base, sont d'une beauté inégalée. Dans les deux salles du premier étage, dont les murs conservent des fragments de fresques médiévales, se trouvent également une croix byzantine et une série de plateaux en laiton gaufré, ciselé et poinçonné de fabrication allemande (XVe et XVIe siècles). Une section est consacrée à l'exposition du mobilier, des vêtements et des accessoires, avec un dispositif scénographique reproduisant le vêtement d'autel baroque et l'image d'une procession. Enfin, l'extraordinaire « Madone de Lorette » de Domenico Fiasella et les imposantes toiles de Gregorio De Ferrari, telles que le « Mort de sainte Scholastique » et « Tobias enterrant les morts », sont des exemples de la grande valeur artistique de la ville. Un riche patrimoine d'œuvres d'art témoigne de la profonde tradition chrétienne et du brillant passé de la République maritime qui, en 1637, couronna la Vierge Marie « Reine de la ville », comme en témoignent les fresques du XVIIIe siècle dans l'anneau supérieur du cloître.