La basilique Santa Cristina abrite l'âme la plus ancienne et la plus spirituelle de Bolsena, qui contraste avec l'atmosphère agréablement insouciante de la promenade du lac et du port de plaisance du village, bondés de restaurants et de clubs. La façade de style Renaissance cache des intérieurs d'inspiration romane et une fondation beaucoup plus ancienne : l'église a été consacrée en 1077 par le pape Grégoire VII, mais ses racines remontent à des époques encore plus anciennes. Elle se dresse en effet au-dessus des catacombes où, selon la tradition, entre la fin du IIIe et le début du IVe siècle, sainte Christine martyre fut enterrée. Pendant des siècles, les pèlerins qui voyageaient le long de la Via Francigena s'y sont arrêtés pour prier dans la grotte de Sainte-Christine, une partie des anciennes catacombes agrandie et transformée, en fait, en crypte de la basilique, avec la tombe de la sainte.

En 1263, c'est précisément dans la grotte que s'est produit ce que l'Église considère comme le miracle eucharistique: des gouttes de sang auraient coulé de l'hostie consacrée, témoignant de la présence réelle du corps et du sang du Christ dans l'Eucharistie et réfutant les doutes nourris par l'officiant, un prêtre bohème. La fresque sur l'arc qui mène à l'hypogée, datant du XIIIe siècle, le rappelle : c'est le plus ancien témoignage iconographique du miracle. D'autres œuvres d'art importantes ornent la basilique, comme un crucifix en bois de l'école ombrienne-siénoise du XVIe siècle, les fresques du XVe siècle de la chapelle du Rosaire et son grand tabernacle, œuvre de Benedetto Buglioni (1493-97), et dans le presbytère, un polyptyque du XVe siècle attribué au siennois Sano di Pietro et à Benvenuto di Giovanni.

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