Situé dans un ancien couvent construit dans la première moitié du XVe siècle par les Jésuites, une congrégation fondée par Giovanni Colombini da Siena en 1367, ce musée est une destination très intéressante. Le nom de la congrégation provient des nombreuses et continues invocations au nom de Jésus, dont le monogramme apparaît également dans certains détails de la structure du couvent. Les religieux s'occupaient des malades, leur offrant des médicaments gratuits, mais ils préparaient également des parfums et des liqueurs à vendre. Le choix du lieu pour la construction du couvent a été motivé par la grande disponibilité d'eau sur la colline de San Pietro.