La cathédrale du XIIe siècle est construite en relation avec un édifice sacré pour la célébration du sacrement du baptême, dédié à saint Jean-Baptiste, qui remonte à 1123. L’intérieur de ce baptistère, de style roman, est divisé en trois nefs et possède une seule grande abside semi-circulaire. Les fonts baptismaux de la fin du XIIe siècle ont une forme octogonale et sont décorés de huit histoires tirées de l’Évangile, attribuées à la jeunesse du sculpteur Brioloto, l’auteur de la rosace de la façade de la basilique Saint-Zénon.
Le baptistère conserve des fresques du XIIIe et du XIVe siècle, mais aussi d’autres œuvres d’un grand intérêt artistique telles qu’une croix stationnaire de Giovanni Badile (première moitié du XVe siècle), une Vierge à l’Enfant et des saints sur panneau de Giovanni Francesco Caroto, datant de 1514, ainsi que le Baptême du Christ, peint par Paolo Farinati en 1568.