Das Museum befindet sich im alten Kloster San Giacomo aus dem 13. Jahrhundert. Seine vier Abteilungen (Archäologie, Numismatik, Kunstgeschichte und zeitgenössische Kunst) sind entlang eines kreisförmigen Weges um den Kreuzgang angeordnet.
Im Inneren befindet sich eine Sammlung von Werken von großer historischer und künstlerischer Bedeutung, die alle aus dem Gebiet der Gemeinde stammen.
Darunter sind die Bronzi Dorati, die einzige Gruppe aus vergoldeter Bronze, die aus der Römerzeit bis heute erhalten geblieben ist. Sie wurden 1946 zufällig von zwei Bauern in Cartoceto di Pergola entdeckt und stammen aus der Zeit zwischen dem 1. Jahrhundert v. Chr. und dem 1. Jahrhundert n. Chr.
Die numismatische Abteilung umfasst auch 238 Münzen, die 1971 von Don Giovanni Carboni an die Gemeinde Pergola gespendet wurden. Die kunsthistorische Abteilung beherbergt schließlich eine Reihe von Werken, die von Gemälden über Skulpturen bis hin zu Holzmöbeln, Drucken und Zeichnungen aus dem 14. bis 18. Jahrhundert reichen.